Надо ли платить НДФЛ в данном случае и каковы последствия неуплаты?

Здравствуйте, Дмитрий!

Вы пишете: 

Получил акции за приватизационные чеки в 1994 г. и продал их в 2018 г. за 100000 р. Надо ли платить НДФЛ?

Да, надо. Статья 214.1. НК РФ определяет особенности  исчисления и уплаты налога на доходы по операциям с ценными бумагами и по операциям с финансовыми инструментами срочных сделок. Как Вы знаете, акции относятся к ценным бумагам.

При определении налоговой базы по доходам по операциям с ценными бумагами и по операциям с финансовыми инструментами срочных сделок учитываются доходы, полученные по следующим операциям:
1) с ценными бумагами, обращающимися на организованном рынке ценных бумаг;
2) с ценными бумагами, не обращающимися на организованном рынке ценных бумаг;